反覆發燒 找不到感染源？mNGS一天揪出隱形病原

反覆發燒、抗生素換了又換，卻始終找不到真正的感染原因？如今，總體基因體次世代定序（mNGS）提供另一項診斷工具，可直接從患者檢體中廣泛搜尋細菌、病毒、黴菌及寄生蟲等病原，最快約1~2天取得結果，協助醫師快速揪出感染源。

面對重症、罕見或未知感染，傳統檢驗有時會遇到「找不到」或「來不及等」的困境。台灣感染症醫學會近日發布「總體基因體次世代定序於鑑定感染症病原之臨床應用建議」，針對mNGS的送檢時機、檢體採集與運送、檢測流程及報告判讀等提出標準化建議，希望讓感染症診斷從過去依賴經驗猜測，進一步走向精準診斷。

mNGS 廣泛掃描

台灣感染症醫學會常務理事陳宜君、秘書長王永志醫師剖析，傳統微生物培養需要兩天甚至更久的時間，如果感染源是病毒、黴菌或寄生蟲，也需要安排不同的特殊檢查；PCR速度快、靈敏度高，但屬於「目標式」（Targeted）檢測，醫師必須先懷疑特定病原才能安排對應檢查。若一開始猜錯方向、病原極為罕見、屬於難培養的真菌或寄生蟲，或是患者已先使用過抗生素，常規檢測就容易落入盲區。

相較之下，mNGS的特色在於「廣」。取得患者檢體後，經過前處理及分析，將人體本身的基因背景去除，再針對剩餘核酸序列進行分析，與病原資料庫比對，不必一開始就鎖定特定病原。

王永志指出，目前資料庫可比對的病原超過兩萬種，涵蓋細菌、病毒、黴菌及寄生蟲等，因此即使醫師一開始不知道究竟是哪一種病原，也有機會從大量基因訊號中找到重要線索。

最快24小時找到線索 

速度也是mNGS一大優點，王永志表示，單就定序流程約1天即可完成，加上檢體處理、資料分析及專業判讀，通常約1~2天可以取得結果。臨床上若患者病況危急，可以考慮在進行細菌培養、PCR等傳統檢驗的同時，同步安排mNGS，盡可能縮短尋找病原的時間。

此外，患者可能同時存在細菌、病毒或黴菌等多重感染，而mNGS並非只針對單一病原進行檢測，而是分析檢體中的多種核酸訊號，因此若患者存在混合感染，也有機會一次發現不同病原，可以協助醫師避免只找到其中一種病原，卻忽略其他可能影響病情的感染來源。

王永志並指出，如果mNGS沒有找到支持感染的證據，也具有臨床參考價值。因為可進一步思考患者是否其實不是感染，而是腫瘤、自體免疫疾病或其他疾病所造成，避免醫療團隊持續沿著感染方向尋找，反而延誤真正病因。

什麼時候需要做基因定序？

至於什麼時機適合做基因定序？王永志強調，並非一發燒或出現感染情形就需要做，如果患者病況穩定，傳統檢驗仍然是重要且成熟的第一線工具。

目前較適合考慮的情況，針對免疫正常的民眾來說，若是傳統檢驗已經做了，卻始終找不到答案、或治療後病況持續變差，此時可以透過基因定序擴大搜尋範圍，尋找原本沒有被鎖定的病原。

另一類是病情危急，沒有時間等待的民眾，像是重症感染、免疫系統缺陷易受感染、中樞神經感染、懷疑多重感染或病況快速惡化的患者，可以考慮傳統檢驗與基因定序同步進行，盡可能縮短確認病原的時間。

找到病原 有助精準用藥

找出真正的病原，另一項重要價值在於協助精準治療。當感染病原尚未確定時，醫師為避免延誤治療，可能先使用涵蓋範圍較廣的抗生素；一旦確認病原及相關資訊，就能依照實際情況調整治療策略，減少不必要的廣效型抗生素使用。

台灣感染症醫學會理事長張峰義表示，感染症治療最重要的是在正確時間做出正確判斷，目前mNGS已逐漸從研究工具走進臨床，臺灣也逐漸累積重症、腦炎、肺炎、免疫功能低下及罕見感染等使用經驗。目前全臺所有醫學中心及半數區域醫院皆已採用此技術，共同構築起守護國人健康的精準感染檢測網。

王振泰也強調，傳統檢驗成熟、費用相對較低，且具有良好的針對性，仍是感染症診斷不可或缺的第一線工具，mNGS真正的價值不是取代醫師或所有傳統檢查，而是在最不確定的時候，提供傳統檢測以外的病原線索。◇